واحد جوجه کشی یکی از قدیمی ترین واحد های شرکت پیگیر واحد جوجه کشی بوده که در محدوده شهرستان آق قلا واقع شده است. اولین تولید آن در سال 1360 از تخم مرغ های وارداتی از هلند انجام شد. این واحد هم اکنون دارای 36 دستگاه ستر و 36 دستگاه هچر در 3 سالن مجزاست و توان بارگیری 932400 عدد تخم مرغ نطفه دار را در هفته دارا می باشد. در سالن های نگهداری جوجه با استفاده از سیستم تهویه مطبوع، دما و رطوبت مناسب نگهداری جوجه ها تا زمان حمل کنترل و تامین می شود. وظایف واحد آزمايشگاهی مستقر در جوجه كشي از این قرارست: انجام كليه آزمايش های ميكروب شناسی، قارچ شناسی و تست های حساسيت دارويی بررسی عملکرد ضدعفونی کننده های مورد استفاده و کنترل كيفيت جوجه های تولید شده